На главную страницу второго семестра

Банки данных Swiss-Prot и UniProt

Данные банка Swiss-Prot о белке SYK1_ECOLI

Описание Метка поля Запись
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) ID SYK1_ECOLI
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P13030; P96756;
Название белка, отражающее его функции DE Лизил-тРНК синтетаза (EC 6.1.1.6) (Lysine--tRNA ligase) (LysRS)
Дата создания документа DT 01-JAN-1990 (Rel. 13, Created)
Дата последнего исправления аннотации DT 01-FEB-2005 (Rel. 46, Last annotation update)
Название организма OS Escherichia coli, and Escherichia coli O6.
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.
Длина последовательности SQ 504 AO
Молекулярная масса белка SQ 57472 а.е.м.
Число публикаций, использованных при создании документа RN 5
Название журнала с самой свежей публикацией RL Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99:17020-17024(2002).
Описание вторичной структуры FT Описание состоит в указании концевых атомов элементов вторичной структуры.
Содержание поля комментариев CC Функции, каталитическая активность, кофакторы, количество субъединиц, расположение, принадлежность.
Особенности последовательности FT Указаны координаты начального и конечного остатка сигнального участка белка, начала и конца цепи белка, координаты дисульфидной связи, координаты лигандов.
Идентификатор файла PDB DR 1BBU

Эту и другую информацию можно получить здесь

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE)

Поиск проводился с помощью внутренней поисковой машины базы данных SRS (Sequence Retrieval System).
Таксон Запрос Количество найденных документов
Археи (Archaea) "(((([swissprot-Description:Lysyl-tRNA*] & [swissprot-Description:synthetase*]) & [swissprot-Description:6.1.1.6*]) | [swissprot-Description:Lysyl-tRNA synthetase 6.1.1.6*]) & [swissprot-Taxonomy:Archaea*]) 19
Бактерии (Bacteria) "(((([swissprot-Description:Lysyl-tRNA*] & [swissprot-Description:synthetase*]) & [swissprot-Description:6.1.1.6*]) | [swissprot-Description:Lysyl-tRNA synthetase 6.1.1.6*]) & [swissprot-Taxonomy:Bacteria*]) " 140
Эукариоты (Eukaryota) "(((([swissprot-Description:Lysyl-tRNA*] & [swissprot-Description:synthetase*]) & [swissprot-Description:6.1.1.6*]) | [swissprot-Description:Lysyl-tRNA synthetase 6.1.1.6*]) & [swissprot-Taxonomy:Eukaryota*]) " 9


© Долудин Юрий, 2005